二十集电视连续剧《百年虚云》是以中国近代禅门宗师虚云长老心坚行苦，慈悲济世的一生为蓝本而编剧的故事。1840年，一个风雨交加的夜晚，泉州知府萧玉堂夫妇中年得子，不料生下一个肉团。萧夫人惊骇而亡，萧玉堂悲愤交加，命仆人将这一肉团丢弃。一药翁飘然而至剖开胞衣，一声惊天动地的啼哭，虚云就这样来到了人间，由此开始了他长达一百二十年…

薛烨是北京人，她很小的时候，父母离异，继母常常虐待她，薛烨忍受不了，只好又回到生母身边。1973年，她来到部队当上了一名电话病。军训的艰苦她不怕，在一次拉练中，她勇敢地救出了一个落水男孩夏夏，也因此认识了夏夏的爸爸黄杨，他们在接触中彼此产生了爱情，薛烨的异母妹妹薛莲写诬告信说薛烨和黄杨关系不正常，使薛烨进军医大学的资格被取…

60年代末的政治风暴席卷中国大地，导弹研究所也深受影响，二室迁到沙漠工作。技术员沈巧从事研究，但对自私的顾雨时当上副所长十分不解。唐天虚把精力全投入到工作中，与敬佩他的黄金桃结婚。沈巧要被调回市里，但她想继续与大家奋斗在沙漠中，上级便批准她做二室主任。金桃在路上分娩了，正巧经过的沈巧帮她照顾孩子。暴雨将至，金桃染病去逝，…