西元2200年, 地球合纵政府开始推行宇宙自治区建设计划, 并在西元2211年正式进入宇宙殖民时代, 西元2300年后, 人类已经建立了超过三百个宇宙自治区, 漂浮于广大的太阳系之中。几百年来，地球、月球、火星以及宇宙海盗组织已经成为了宇宙的四大势力，四方势力互相拉锯。最终，人类能否突破自身的斗争宿命，能否真正迈入历史上的新世纪呢？

公元2458年，地球与火星引力环移民，为了火星稀土征收事件，在月球空域爆发战争。在双方均付出惨痛代价后，火星与地球终止一切交流，开启了短暂的和平。零战时代，除了火星的威胁外，由月球罪犯组成的宇宙海盗，日益猖獗。一百多年的和平在西元2588年终结。在月球城邦爆发新型流感H1Z1而束手无策时，隔绝已久的火星释出善意，派出医疗舰前往月球…